Công ty mẹ:

Tổng công ty Công nghiệp thực phẩm Đồng Nai là doanh nghiệp Nhà nước do Nhà nước là chủ sở hữu, Ủy ban nhân dân tỉnh Đồng Nai là cơ quan đại diện chủ sở hữu. Tổng công ty được tổ chức theo hình thức công ty trách nhiệm hữu hạn một thành viên, hoạt động theo mô hình công ty mẹ - công ty con, phù hợp với quy định của Luật Doanh nghiệp, của pháp luật có liên quan và Điều lệ Tổng công ty.

Cơ cấu tổ chức quản lý, và điều hành của Tổng công ty gồm có:
           - Hội đồng thành viên;
           - Ban Kiểm soát;
           - Tổng Giám đốc và các Phó Tổng Giám đốc;
           - Kế toán trưởng;
           - Các phòng, phân xưởng, Trạm, Ban;

1. Hội đồng thành viên

Hội đồng Thành viên là đại diện Chủ sở hữu trực tiếp tại Tổng công ty; nhân danh chủ sở hữu Tổng công ty thực hiện các quyền và nghĩa vụ của chủ sở hữu Tổng công ty, nhân danh Tổng công ty thực hiện các quyền và nghĩa vụ của Tổng công ty (trừ quyền và nghĩa vụ của Tổng Giám đốc).
Hiện tại, Hội đồng thành viên Tổng công ty gồm có:
- Bà Trần Thị Vũ Hậu, Chủ tịch Hội Đồng Thành Viên;
- Ông Văn Hữu Đồng, Thành viên Hội đồng thành viên; - Tổng giám đốc;
- Bà Phan Phương Phúc Phú, Thành viên Hội đồng thành viên;

2. Ban Kiểm soát

Ban Kiểm soát của Tổng công ty gồm 02 Kiểm soát viên do Chủ sở hữu quyết định bổ nhiệm.
Hiện tại, Ban Kiểm soát Tổng công ty gồm có 02 thành viên:
- Ông Nguyễn Diên Anh Khoa, Kiểm soát viên;

3. Tổng giám đốc và các Phó Tổng giám đốc

Tổng Giám đốc trực tiếp điều hành các hoạt động của Tổng công ty, có chức năng tổ chức thực hiện các nhiệm vụ sản xuất kinh doanh do Nhà nước, Hội đồng thành viên giao, chịu trách nhiệm trước Hội đồng Thành viên Tổng công ty, trước Chủ sở hữu và pháp luật về thực hiện quyền và nhiệm vụ được giao trong điều hành hoạt động của Tổng công ty.
Phó Tổng Giám đốc giúp Tổng Giám đốc điều hành Tổng công ty theo phân công và ủy quyền của Tổng Giám đốc; chịu trách nhiệm trước Tổng Giám đốc và trước pháp luật về nhiệm vụ được phân công và ủy quyền.

Hiện tại, Ban Điều hành Tổng công ty gồm có:
- Ông Văn Hữu Đồng, TV.HĐTV - Tổng giám đốc;
- Ông Phạm Nam Hưng, Phó Tổng giám đốc;
- Ông Nguyễn Đức Khoa, Phó Tổng giám đốc;
- Ông Trần Đăng Ninh, Phó Tổng giám đốc;

4. Kế toán trưởng

Kế toán trưởng Tổng công ty có nhiệm vụ tổ chức thực hiện công tác kế toán tài chính, thống kê của Tổng công ty, giúp Tổng giám đốc giám sát tài chính tại Tổng công ty theo pháp luật về tài chính, kế toán; chịu trách nhiệm trước Tổng giám đốc, Hội đồng Thành viên và trước pháp luật về nhiệm vụ được phân công hoặc ủy quyền; tiêu chuẩn tuyển chọn Kế toán trưởng Tổng công ty thực hiện theo quy định của pháp luật về kế toán và các quy định khác của pháp luật có liên quan.
Hiện tại, Kế toán trưởng Tổng công ty do ông Trần Hữu Đức đảm nhận.

5. Các phòng, phân xưởng, Trạm, Ban.

Tổng công ty (Công ty mẹ) hiện có các phòng, ban chuyên môn, nghiệp vụ có chức năng tham mưu, kiểm tra, giúp việc Hội đồng thành viên, Tổng giám đốc quản lý, điều hành hoạt động sản xuất kinh doanh Tổng công ty (Công ty mẹ) và thực hiện chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn của chủ sở hữu đối với các doanh nghiệp khác. Hiện tại, bộ phận gián tiếp của Tổng công ty gồm có: Văn phòng, Phòng Nghiệp vụ tổng hợp, Phòng Tổ chức lao động, Phòng Kế toán tài chính, Phòng Quản trị & Kiểm toán nội bộ, Phòng Thị trường, Phòng Kế hoạch tổng hợp, Phòng Dự án, Phòng Pháp chế, Ban An toàn Chất lượng.

Bên cạnh đó, Tổng công ty còn có 01 Nhà máy sản xuất thuốc lá với các phân xưởng sản xuất như Phân xưởng Sợi, Phân xưởng Thành phẩm, Phân xưởng Hợp tác và các phòng nghiệp vụ phục vụ hoạt động sản xuất như: Phòng Công nghệ sản phẩm, Phòng Kiểm tra chất lượng sản phẩm, Phòng Kỹ thuật – Cơ điện và Môi trường, Trạm Dịch vụ Kỹ thuật nông nghiệp.